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读研必知:蛋白纯化标签的种类与选择 在分子生物学研究中,蛋白纯化标签(protein tag)是一个非常重要的概念。通过DNA体外重组技术,可以将标签蛋白与目的蛋白融合表达,从而方便目的蛋白的表达、检测、示踪和纯化。随着技术的不断发展,科研人员已经开发出多种具有不同功能的蛋白标签。 目前,常用的体外重组蛋白表达系统主要有四大类:原核表达系统、哺乳动物细胞表达系统、酵母表达系统和昆虫细胞表达系统。实验的主要步骤包括载体构建、表达鉴定和蛋白纯化。在构建载体时,除了需要一些必要的表达元件外,还需要考虑目的蛋白的密码子优化和蛋白标签的选择。 选择合适的蛋白标签不仅有利于蛋白的纯化,还能促进蛋白的可溶性,同时不影响蛋白的结构功能和下游应用。以下是四种常见的蛋白纯化标签,供大家参考: 融合标签:这类标签通常与目的蛋白一起融合表达,便于通过亲和层析等方法进行纯化。 His标签:含有组氨酸残基的标签,可以通过镍离子亲和层析进行纯化。 GST标签:谷胱甘肽S转移酶标签,可以通过谷胱甘肽亲和层析进行纯化。 FLAG标签:含有FLAG序列的标签,可以通过抗FLAG抗体进行免疫沉淀或免疫荧光等方法进行检测和纯化。 了解这些标签的特性和用途,可以帮助你更好地设计实验方案,提高实验效率和质量。
쨴觲载体构建全攻略✨ 你是否对质粒载体构建感到困惑?别担心,这篇攻略将带你一步步了解整个流程! ᠪ*质粒载体设计** * **优化序列**:通过突变或重组技术,提升质粒在宿主细胞中的复制效率和稳定性。 * **添加元件**:为质粒添加启动子、终止子等,增强其功能和表达效率。 * **多克隆位点**:设计并插入多克隆位点,提供多个独特的酶切位点,方便插入外源基因。 * **高拷贝数质粒**:改造质粒以增加其在宿主细胞中的拷贝数,提高外源基因的表达量。 젪*质粒载体类型** * **克隆载体**:按用途分类,包括原核载体、真核表达载体等。 * **表达调控载体**:体外转录载体、基因表达载体等,用于实现基因的表达调控。 **重组蛋白表达载体** * **特点**:含有目标蛋白筛选、纯化的特定标签元件。 * **限制**:成本高,放大困难,部分蛋白因结构复杂而无法高效表达。 **非编码RNA表达载体** * **特点**:调控基因表达,引发免疫反应。 * **应用**:研究非编码RNA生物学功能,治疗某些由异常基因表达引起的疾病。 ꠪*CRISPR Cas9敲除载体** * **特点**:基于CRISPR-Cas9系统的基因敲除工具,具有高度的RNA识别和切割能力。 * **应用**:编辑对象包括DNA和RNA,广泛应用于各种生物体系。 ᠪ*常见问题及解决方案** * **重组效率低**:优化酶切、连接条件,或尝试使用不同的连接酶。 * **外源基因片段丢失**:检查酶切位点是否正确,避免使用非特异性酶切。 * **重组质粒不稳定**:在质粒载体上加入稳定序列,如复制原点、选择标记等。 ✨ 现在,你是否对质粒载体构建有了更清晰的了解呢?赶快行动起来吧!
一分钟搞懂基因过表达、敲低、敲除的区别 嘿,大家好!今天咱们来聊聊基因操作里的三个常见术语:过表达、敲低和敲除。别担心,只需要一分钟,你就能搞懂它们的区别啦! 基因过表达 基因过表达,简单来说,就是把一个基因插到一个表达载体里,然后把这个载体转染到目标细胞里。这样一来,细胞就会大量表达这个基因和它编码的蛋白质。常见的载体有哺乳动物载体(用于人、小鼠等哺乳动物细胞)、原核载体(用于大肠杆菌等原核生物)和慢病毒载体(比如HIV、FIV、SIV、EIA)。构建这些载体的方法包括设计目的基因片段和载体、连接元件(用酶切或gateway连接),然后通过病毒载体、电穿孔或转染试剂导入目标细胞。 基因敲低 基因敲低呢,主要是用抑制剂来抑制基因的表达。常见的方法有RNA干扰技术(RNAi)、CRISPR-Cas9技术和gene转染技术。比如,siRNA载体通过与目标mRNA互补结合序列,特异性地实现靶向mRNA降解。而CRISPR载体则包含CRISPR靶向序列和转录抑制子。构建这些载体的步骤包括设计干扰序列、合成和克隆、转化和筛选,最后通过病毒等途径导入目标细胞。 基因敲除 ✂️ 基因敲除则是用含有已知序列的小DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合到受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。常见的载体有CRISPR/Cas9载体和TALENs载体。CRISPR/Cas9载体通过Cas9核酸酶和sgRNA靶向序列精确定位并靶向基因DNA序列,然后引入双链断裂点,完成基因敲除。而TALENs载体则包含特异性核酸酶和nuclease binding domain,通过切割靶向基因DNA序列,完成敲除和编辑。构建这些载体的方法包括设计和选择靶点、载体插入、转化和验证,最后通过病毒载体、电穿孔等方法导入目标细胞。 总结 总的来说,基因过表达、敲低和敲除这三种技术在生物学研究中有着广泛的应用。了解它们的原理和构建方法,可以帮助你更好地设计和执行实验。希望这篇文章能让你在短时间内对它们有个清晰的认识!如果你有任何问题或需要进一步的解释,欢迎在评论区留言哦!
如何解读质粒图谱:一文搞懂所有细节 解读质粒图谱,首先要搞清楚几个关键点: 1️⃣ 箭头方向:质粒图谱上的箭头有两种含义。一种是转录方向,箭头从启动子开始,指示序列的顺序。另一种是复制起始位点的方向,表示质粒在大肠杆菌等细菌或真菌中DNA复制的路径。 2️⃣ 标签解读: ri:代表DNA复制起始位点。在大肠杆菌中,通常是pUC类的质粒,或者是F1启动子(如图1所示),用于噬菌体的复制。如果图谱上只有一个ori,表示质粒是原核克隆及表达质粒;如果有两个ori,则表示该质粒是穿梭质粒,既可以在原核也可以在真核中复制。 :代表启动子,如CMV启动子(如图2所示),用于启动后面的表达蛋白。常见的启动子还有EF1(启动长片段)、H1、U6(启动短片段,如shRNA)。 性基因:常见的有Amp(氨苄青霉)、Tet(四环素)、Cmr(氯霉素)、SM(链霉素)、Hyg(潮霉素)(如图3所示)。 A:转录终止位点(如图4所示)。 契基因:如copGFP(绿色荧光蛋白)、Puro(嘌呤霉素)、Lacz(乳糖操纵子)等(如图5所示)。报告基因用于显示过表达或敲减的基因是否正常运作。 3️⃣ 多克隆位点(MCS):MCS是一系列限制性内切酶酶切位点,是外源DNA的插入位点。通过酶切/连接的方式,可以将外源DNA插入质粒中。 4️⃣ 外源DNA片段:质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率也越低。 这样解读质粒图谱,你心里是不是更有数了呢!
쨴觲载体构建全攻略슰想要了解质粒载体的构建流程吗?这里为你详细解析! 1️⃣ 复制起始位点(Ori) :这是质粒复制的关键,通过它募集复制蛋白,启动质粒的复制过程。 2️⃣ 筛选标记(抗生素抗性基因) :质粒中的筛选标签,方便通过抗生素筛选出阳性克隆。单抗性多见于原核克隆和表达载体,而两种或以上抗性的则是穿梭质粒。 3️⃣ 多克隆位点(MCS) :包含多个限制性酶切位点的DNA序列,用于插入目的基因,并选择合适的限制性内切酶进行克隆。 4️⃣ 表达系统元件 ᯼区分克隆载体与表达载体的关键。加入表达调控元件,如启动子、核糖体结合位点等,即可将克隆载体转化为表达载体。 5️⃣ Insert 插入片段 쯼这是克隆到MCS中的基因或其他DNA片段,通常是研究的重点。 6️⃣ Selectable Marker:选择性标记 ,用于筛选成功摄取质粒的细胞。 7️⃣ Primer Binding Site:引物结合位点(PBS) 쯼用于PCR扩增或测序,以及验证质粒序列。 现在,你是否对质粒载体的构建有了更全面的了解呢?✨
启动子:转录的秘密开关 犤𛊥䩦们来聊聊启动子(Promoter),这个在分子生物学中扮演着重要角色的DNA序列。启动子是RNA聚合酶识别、结合和开始转录的关键,它含有RNA聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列,通常位于结构基因转录起始点的上游。启动子本身不会被转录,但它决定了基因何时、何地以及如何被表达。 启动子的基本结构 튊原核生物的启动子一般长度在20bp到200bp之间,主要由四部分组成: CAT序列:这是转录起始位点。 Pribnow框:含有共有序列TATAAT,是RNA聚合酶的结合位点,启动子的强度很大程度上由这一序列决定。 Sextama框:共有序列是TTGACA,是RNA聚合酶的识别位点。 间隔区:由两段长为6个核苷酸的保守序列组成,被非特异性的17-19个核苷酸序列分隔。 启动子的分类 根据对转录水平控制的程度,启动子可以分为弱启动子和强启动子。参照转录模式,启动子又可以分为以下几类: 组成型启动子(constitutive promoter):这类启动子能够调控结构基因的表达基本恒定,在不同部位或组织表达水平差异不明显。 组织特异启动子(tissue-specific promoter):这类启动子的调控作用使得基因往往只在某些特定的器官或组织部位表达,且表现出发育调节的特性。 诱导型启动子(inducible promoter):在某些特定的物理或化学信号刺激后,基因转录水平在该类型启动子调控下大幅度地提升。 特异性启动子 特异性启动子是能够使基因进行转录的一段DNA序列。它常位于目的基因上游100-2000bp位置处,是质粒非常重要的一个元件。特异性启动子决定了目的基因可以在何种细胞中进行表达,也决定了蛋白质的表达量。 常见的启动子 图3-图5展示了一些常见的真核启动子,而图6则展示了一些常见的原核启动子。这些启动子的结构和功能各有不同,但它们都在细胞的生命活动中扮演着重要角色。 通过了解这些启动子的基本结构和分类,我们可以更好地理解基因表达调控的复杂性,以及如何通过操纵这些开关来控制细胞的行为。希望这篇文章能为你提供一些有用的信息!
质粒图谱详解:四大要素及常见元件 在生物科研领域,质粒是一个常见且重要的概念。当你面对质粒图谱时,可能会被各种箭头和英文序列搞得一头雾水。别担心,今天我就来为你详细解读质粒图谱的四大要素和一些常见的元件。 复制起点:质粒的“心脏” 首先,我们来说说复制起点。质粒的复制起点决定了质粒的宿主和拷贝数。图谱中的ori就是复制起点的标志。如果图谱上只有一个ori,那这个质粒通常是原核克隆和表达质粒。而如果图谱上有两个ori,那这个质粒就是穿梭质粒,可以在原核和真核细胞中复制。 筛选标记:质粒的“身份证” 接下来是筛选标记。图谱中的AmpR、KanR等表示抗生素抗性基因,这些基因方便我们通过抗生素筛选阳性克隆。一般来说,只存在单抗性的质粒多是原核克隆载体和原核表达载体,而存在两种或以上抗性的多为穿梭质粒。 多克隆位点:外源基因的“入口” ꊥ䚥 隆位点是多外源DNA的插入位点,通常位于转录启动和转录终止信号之间。图谱中的MCS区或者许多内切酶集中的部分就是多克隆位点。通过酶切后连接的方式,我们可以将外源DNA插入质粒。 其他元件:质粒的“配件” ️ 除了复制起始位点、筛选标记和多克隆位点外,质粒载体中还有一些其他的表达或调控元件,如转录调控元件、翻译调控元件和融合表达标签蛋白等。这些元件可以增强质粒的功能性,比如蛋白纯化标签蛋白(如His-Tag、GST-tag)、蛋白检测标签蛋白(如Myc-Tag、Flag-Tag、HA-Tag)以及荧光蛋白表达标签(如GFP、mCherry)。 希望这篇文章能帮你更好地理解质粒图谱,赶紧找个质粒图谱去看看吧!相信你会有更多的收获!
生物竞赛生必看!基因工程大题满分攻略 嘿,生物竞赛的小伙伴们!今天咱们来聊聊基因工程那些事儿,特别是如何在大题中秒杀对手。准备好了吗?Let's go! 引物的作用 슥饰𑥃是DNA聚合酶的导航仪,让它们知道在哪里开始复制。通常,引物会选择5’→3’的方向延伸,有些题目会涉及到酶切位点或融合基因序列,这时候你就需要找到对应的互补序列。 合成引物的前提 首先,你得有一段已知的目的基因的DNA序列,这样才能设计出合适的引物。 限制酶酶切位点的选择 ✂️ 限制酶的酶切位点一般放在5’端,这样可以避免影响引物的正常延伸。 基因表达载体的基本元件 一个完整的基因表达载体需要包含复制原点、启动子、目的基因、终止子和标记基因。 启动子的作用 劥壘襭就像是RNA聚合酶的钥匙,让它们知道从哪里开始转录。 标记基因的用途 记基因用来筛选那些成功导入重组质粒的细胞。 如何获取cDNA 通过提取某个生物的全mRNA,然后逆转录形成cDNA。cDNA不含启动子、终止子和内含子,这样可以避免不同生物基因无法表达的问题。 cDNA文库的优点 使用cDNA文库可以方便快捷地克隆基因,尤其是克服原核生物和真核生物基因结构不同的困难。 单酶切的潜在问题 능酶切可能会导致质粒自身环化、目的基因自身环化或者目的基因反向连接。 标记基因的复杂性 銦时候,即使只有一种标记基因的重组表达载体导入个体,也不一定说明重组成功,因为空白质粒也可能含有标记基因。所以,一般会用双抗性基因鉴定方法。 如何将目的基因导入受体细胞 𑊦䍧駻胞:农杆菌转化法(双子叶、裸子植物)、花粉管通道法(我国首创)、基因枪法(单子叶植物) 动物细胞:显微注射法(注射受精卵) 微生物细胞:Caⲫ感受态法(使微生物处于一种易于吸收外界DNA分子的状态) 农杆菌转化法的T-DNA 杆菌转化法中,T-DNA是转移DNA,负责将目的基因转移到植物细胞中。 好了,今天的分享就到这里。希望这些小技巧能帮到你们,在生物竞赛中取得好成绩!加油!ꀀ
分子生物学中的十一大关键概念解析 分子生物学涉及许多复杂的分子概念,如启动子、终止子、沉默子、顺反子等,这些名词常常让人混淆。以下是这些关键概念的详细解释,帮助你更好地理解分子生物学的核心内容。 启动子(Promoter) 启动子是RNA聚合酶识别和结合的区域,用于开始转录过程。它是基因表达的关键调控元件。 终止子(Terminator) 终止子标志着基因转录的结束,是基因表达过程中的重要信号。 沉默子(Silencer) 沉默子通过抑制基因转录来调节基因表达,是基因表达调控的一种方式。 顺反子(Cistron) 顺反子是指一个启动子控制一个编码序列,即一个基因转录后只生成一个mRNA分子,这个mRNA分子只编码一个蛋白质。 增强子(Enhancer)ꊥ➥퐩过增强启动子的活性来促进基因转录,是基因表达调控的一种积极机制。 绝缘子(Insulator) 绝缘子通过阻止染色质结构域之间的相互作用,来保护基因的转录活性,是基因表达调控的一种保护机制。 外显子(Exon) 外显子是基因序列中编码蛋白质的DNA片段,在mRNA前体剪接过程中被保留下来,最终成为成熟mRNA的一部分。 内含子(Intron) ️ 内含子是存在于基因序列中,但在mRNA剪接过程中会被去除的非编码DNA序列。内含子在真核生物的基因中普遍存在,对基因表达调控、物种进化和遗传多样性有重要作用。 操纵子(Operon)犦纵子是原核生物基因表达调控的一种基本单位,由一个或多个结构基因、调控序列和启动子组成。操纵子通过调控序列对环境信号作出反应,从而控制结构基因的表达。 单顺反子(Monocistronic) 单顺反子是指在基因表达中,一个启动子控制一个编码序列,即一个基因转录后只生成一个mRNA分子,这个mRNA分子只编码一个蛋白质。这种结构在真核生物中非常普遍。 多顺反子(Polycistronic) 多顺反子是指多个编码序列由一个启动子控制,转录后形成一个大的mRNA分子,这个mRNA分子可以编码多个蛋白质。这种现象在原核生物中较为常见,体现了原核生物基因表达调控的紧凑性和经济性。 通过这些概念的解释,希望能帮助你更好地理解分子生物学的复杂性和多样性。
如何阅读质粒图谱:简单五步搞定! ꧬ줸步:首先找到 Ori 的位置,了解质粒的类型(原核、真核或穿梭质粒)。 ꧬ줺步:接着看筛选标记,例如抗性标记,决定使用哪种筛选标记。例如: Ampr:水解 酰胺环,解除氨苄的毒性。 tetr:阻止四环素进入细胞。 camr:生成氯霉素羟乙酰基衍生物,使之失去毒性。 neor(kanr):氨基糖苷磷酸转移酶使G418(长那霉素衍生物)失活。 hygr:使潮霉素䱦 ꧬ줸步:查看多克隆位点(MCS),它具有多个限制酶的单一切点,便于外源基因的插入。如果在这些位点外有外源基因的插入,会导致某种标志基因的失活而便于筛选。决定能不能放目的基因以及如何放置目的基因。 ꧬ쥛步:再看外源 DNA 插入片段大小。质粒一般只能容纳小于10Kb的外源DNA片段。一般来说,外源DNA片段越长,越难插入,越不稳定,转化效率越低。 ꧬ줺步:检查是否含有表达系统元件,即启动子-核糖体结合位点-克隆位点-转录终止信号。这是用来区别克隆载体与表达载体。克隆载体中加入一些与表达调控有关的元件即成为表达载体。选用那种载体,还是要以实验目的为准绳。 启动子:促进DNA转录的DNA顺序,这个DNA区域常在基因或操纵子编码顺序的上游,是DNA分子上可以与RNApol特异性结合并使之开始转录的部位,但启动子本身不被转录。 增强子/沉默子:为真核基因组(包括真核病毒基因组)中的一种具有增强邻近基因转录过程的调控顺序。其作用与增强子所在的位置或方向无关。即在所调控基因上游或下游均可发挥作用。/沉默子-负增强子,负调控序列。 核糖体结合位点/起始密码/SD序列(Rbs/AGU/SDs):mRNA有核糖体的两个结合位点,对于原核而言是AUG(起始密码)和SD序列。 转录终止顺序(终止子)/翻译终止密码子:结构基因的最后一个外显子中有一个 AATAAA 的保守序列,此位点 down-stream 有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。结构基因的最后一个外显子中有一个AATAAA的保守序列,此位点down-stream有一段GT或T富丰区,这2部分共同构成poly(A)加尾信号。
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